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核酸化学
1.核苷酸的组成与分类
核苷酸可分解成核苷和磷酸,核苷又可分解为碱基和戊糖。因此核苷酸由三类分子片断组成。戊糖有两种,D-核糖和D-2-脱氧核糖。因此核酸可分为两类:DNA和RNA。
核苷酸是由含氮有机碱(称碱基)、戊糖(即五碳糖)和磷酸三部分构成的。核酸是由众多核苷酸聚合而成的多聚核苷酸,相邻二个核苷酸之间的连接键为3',5'-磷酸二酯键。
核苷酸是合成生物大分子核糖核酸 (RNA)及脱氧核糖核酸(DNA)的前身物,RNA中主要有四种类型的核苷酸DNA中主要有四种类型脱氧核苷酸,共八种。
RNA中主要有四种类型的核苷酸:AMP、GMP、CMP和UMP。
DNA中主要有四种类型脱氧核苷酸:dAMP、dGMP、dCMP和dTMP。
核苷酸一类由嘌呤碱或嘧啶碱、核糖或脱氧核糖以及磷酸三种物质组成的化合物。又称核甙酸。戊糖与有机碱合成核苷,核苷与磷酸合成核苷酸,4种核苷酸组成核酸。核苷酸主要参与构成核酸,许多单核苷酸也具有多种重要的生物学功能,如与能量代谢有关的三磷酸腺苷、脱氢辅酶等。
2. DNA 结构
(1)DNA 的一级结构
在DNA分子中,相邻核苷酸以3’,5’-磷酸二酯键连接构成长链,前一个核苷酸的3’-羟基与后一个核苷酸的5’-磷酸结合。
DNA的一级结构是它的构件的组成及排列顺序,即碱基序列。
书写DNA时,按从5’向3’方向从左向右进行,并在链端注明5’和3’。
基因也称为顺反子,泛指被转录的一个DNA片段。在某些情况下,基因常用来指编码一个功能蛋白或DNA分子的DNA片段。
在分子生物学和遗传学领域,基因组是指生物体所有遗传物质的总和。
内含子又称间隔顺序,指一个基因或mRNA分子中无编码作用的版段。
外显子是真核生物基因的一部分。它在剪接后会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。
(2)DNA 双螺旋结构
DNA双螺旋是由两条反向、平行、互补的DNA链构成的右手双螺旋。两条链的脱氧核糖磷酸骨架反向、平行地按右手螺旋走向,绕一个共同的轴盘旋在双螺旋的外侧,两条链的碱基一一对应互补配对,集中地平行排列在双螺旋的中央,碱基平面与轴垂直。DNA双螺旋中的两条链互为互补链。
双螺旋模型的意义,不仅意味着探明了DNA分子的结构,更重要的是它还提示了DNA的复制机制。
有两种作用力稳定双螺旋的结构。在水平方向是配对碱基之间的氢键,A=T对形成两个氢键,GC对形成三个氢键。这些氢键是克服两条链间磷酸基团的斥力,使两条链互相结合的主要作用力。在垂直方向,是碱基对平面间的堆积力。堆积力是疏水力与范德华力的共同体现。氢键与堆积力两者本身都是一种协同性相互作用,两者之间也有协同作用。
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